Os voy a relatar el problema que he tenido y como he topado con un blog en el que hay una posible solución pasajera, por lo menos hasta que los desarrolladores de Ubuntu saquen algun punto y final a este problema.
Uno de mis portátiles es un Acer Aspire Serie 5920, el cual venía con Windows Vista y visto lo visto, a los pocos meses me pasé a la versión anterior, el Windows XP; me empezó a dar problemas la aceleradora gráfica integrada Intel que tiene dicho aparato, por lo que a los pocos meses cogí y me cambié al software libre, me pasé a Ubuntu 8 me iba bastante bien, obviando los típicos problemas que surgen al cambiarte de un sistema operativo a otro. Al salir la nueva versión, Ubuntu 9.04 me volví a cambiar y me surgió el mismo problema que tenía con el XP, aleatoriamente escogía un momento del día para volverse loco, y volverme a mí, con un parpadeo incesante de la pantalla, así que empecé a buscar a ver que podía hacer.
Lo primero que encontré fue que al programar la nueva versión de Ubuntu, las Intel estaban dando problemas y sin vacilarlo, las metieron en una lista negra, esto se arreglaba editando el activarcompiz.sh y ponerlo como aplicación a ejecutar al inicio; el problema seguía igual, el parpadeo ‘porculero’; hasta que hoy he dado con esto.
Por lo menos a mí me está funcionando bastante bien, no ha vuelto el parpadeo del demonio; por lo que creo que, por ahora, el problema está solucionado.
En los primeros pasos, en concreto al meter la key de autentificación de software de terceros, os da error si lo hacéis por la terminal, así que os recomiendo iros a la esquina superior izquierda de vuestro Escritorio y en Sistema\Administración\Orígenes del Software cliqueáis en la pestaña de Autenticación y antes de pulsar Importar clave, os dirigís de nuevo al Escritorio, allí Boton derecho\Crear un documento\Archivo vacío y copiáis esto:
-----BEGIN PGP PUBLIC KEY BLOCK----- Version: SKS 1.0.10 mI0ESXU+AgEEAJ9TRYo1sAu9oDLsHayx2FZIOdYxfV0vQbEk6V3fsrzwSa9VuFw0zewZDibK 7x6w1yZ/dB2w55mTX9aYq3620VtmcF/rtsH7GAw+EFe8pc6pLZHEEZ6/eVg0YdkRML6vxKv/ iOoa5CX+gO4sMy1ueTnadb2dXU5qXpykqwoqm/QrABEBAAG0JExhdW5jaHBhZCBQUEEgZm9y IHhvcmcgY3JhY2sgcHVzaGVyc4i2BBMBAgAgBQJJdT4CAhsDBgsJCAcDAgQVAggDBBYCAwEC HgECF4AACgkQTxkaWohExUI8UwQAnl0kr186R1/u4Kjcqoywz4hYQ0OwDRPymQtK4wA4/I/a 3nLx18q5YUOLRGIXqOE/TA8Z7C5W+oyM4Vvrj9DEVmvDgi2zumg3HBw0iy+9w79QBVhjHkak ILP3q/NFmUOe64XI9llEw6sSZ/aJRgMNvIfu6ThFxWAMuh1qBxH9AOY= =ZVmk -----END PGP PUBLIC KEY BLOCK-----
Guardad y cerrad el archivo, y ahora sí podéis cliquear en Importar clave, eligiendo el archivo donde habéis copiado previamente lo anterior. Atención comprobad que lo pegado es igual a lo aquí escrito, sino es así, copiadlo de aquí.
Os dirigís ahora a la pestaña de Software de Terceros, pulsad Añadir y pegad lo siguiente:
deb http://ppa.launchpad.net/xorg-edgers/ppa/ubuntu jaunty main
Tras aceptar, os saldrá un mensaje diciendo Recargar, pulsad y cerrad.
Lo siguiente es iros de nuevo al menú superior del Escritorio, cliquead en Aplicaciones\Accesorios\Terminal y seguid el ‘Paso 2‘.
Espero que os funcione, a mí por ahora me ha salvado de la situación en la que estaba. 
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